La tercera película, Men in Black, es una continuación de la famosa comedia estadounidense. El reparto son los mismos Tommy Lee Jones y Will Smith. El trabajo del director fue nuevamente asumido por Barry Sonnenfeld, productor ejecutivo de Steven Spielberg. En los cines, la película comenzó el 23 de mayo de 2012.
Esta vez, el papel del héroe negativo es tomado por Jamain Clement, él interpreta a Boris. Este es un delincuente que escapó de la prisión lunar. Arde de odio por el Agente Kay, quien en julio de 1969 atrapó al criminal y lo dejó sin una mano. Cuando Kay descubre repentinamente que Boris estaba corriendo, lamenta mucho no haberlo matado durante el arresto. Después de eso, el agente simplemente desaparece, y solo Jane recuerda que él existió. El resto del personal de negro cree que Kay murió en un enfrentamiento con un criminal en 1969.
La única explicación para este trastorno de la realidad es un cambio en el pasado. Jay y el Agente O deciden que fue Boris quien estuvo involucrado. La confirmación de esto es otro evento de escala cósmica: la invasión de la raza de Boris en la Tierra. En la realidad anterior, esto era imposible, ya que Kay instaló un dispositivo de protección en el planeta llamado "ArcNet". Ahora, en relación con la muerte del agente hace unas décadas, la Tierra no tenía ninguna investigación de los enemigos espaciales.
Jay descubre que Boris fue enviado al pasado por Jeffrey Price, un distribuidor de productos electrónicos que tenía un cambio de horario ilegal en su arsenal. El agente no tiene más remedio que retroceder en el tiempo para salvar a su compañero. Y es arrestado inmediatamente por la joven Kay. Durante el interrogatorio, Jay le cuenta todo y el futuro compañero cree. Juntos encuentran al Griffin arcaniano, que tiene ArkNet. Ahora los tres continúan su viaje y parten para establecer protección en la luna. Pero en un cohete son arrestados por el coronel. Ahora se convierte en el guardián del misterio de Jay.
A partir de este momento, tiene lugar un rápido desarrollo de eventos. Los héroes se encuentran con dos Boris y se produce una pelea. Un criminal del futuro es arrojado a una mina de cohetes, y el joven Boris también lo persigue. Protección de tierra instalada. Y ahora, parece que la misión de Jay se completó, pero aparece un joven criminal milagroso sobreviviente. El coronel muere, pero Boris logra ser destruido. Y en la película aparece un nuevo personaje. Un niño sale del auto del coronel y comienza a buscar a su padre. El agente se reconoce a sí mismo. Jay regresa a su debido tiempo y se encuentra con Kay en la cafetería. Todo ha vuelto.